<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">vetpress</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Аграрная наука</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Agrarian science</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">0869-8155</issn><issn pub-type="epub">2686-701X</issn><publisher><publisher-name>Редакция журнала "Аграрная наука"</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.32634/0869-8155-2023-372-7-58-62</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">vetpress-2701</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ЗООТЕХНИЯ И ВЕТЕРИНАРИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ZOOTECHNICS AND VETERINARY MEDICINE</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Сравнительная генетическая характеристика микросателлитного профиля голштинизированных и чистопородных холмогорских быков</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Comparative genetic characteristics of microsatellite profile of holstein and purebred kholmogorsky bulls</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5485-4616</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Николаев</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Nikolaev</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Семен Викторович Николаев, кандидат ветеринарных наук, научный сотрудник,</p><p>ул. Ручейная, 29, Сыктывкар, 167023</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Semen Viktorovich Nikolaev, Candidate of Veterinary Sciences, Researcher,</p><p>29 Rucheynaya Str., Syktyvkar, 167023</p></bio><email xlink:type="simple">semen.nikolaev.90@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0215-9715</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ялуга</surname><given-names>В. Л.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Yaluga</surname><given-names>V. L.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Владимир Леонтьевич Ялуга, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,</p><p>пр-т Никольский, 20, Архангельск, 163020</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir Leontievich Yaluga, candidate of Biological Sciences, Senior Researcher,</p><p>20 Nikolsky Ave., Arkhangelsk, 163020</p></bio><email xlink:type="simple">yaluga29@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Институт агробиотехнологий им. А.В. Журавского ФИЦ «Коми научный центр Уральского отделения Российской академии наук»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>A.V. Zhuravsky Institute of Agrobiotechnologies of the Komi Scientific Center of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики им. академика Н.П. Лаверова Уральского отделения Российской академии наук</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>The Federal Research Center for the Integrated Study of the Arctic named after Academician N.P. Laverov of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>27</day><month>07</month><year>2023</year></pub-date><volume>0</volume><issue>7</issue><fpage>58</fpage><lpage>62</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Николаев С.В., Ялуга В.Л., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Николаев С.В., Ялуга В.Л.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Nikolaev S.V., Yaluga V.L.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.vetpress.ru/jour/article/view/2701">https://www.vetpress.ru/jour/article/view/2701</self-uri><abstract><sec><title>Актуальность</title><p>Актуальность. По причине повсеместной метизации холмогорская порода находится на грани полного исчезновения, что требует разработки мероприятий, направленных на сохранение не только самих животных, но и их генетического разнообразия. Для анализа генетического состояния популяции наиболее удобными можно считать микросателлиты, что обусловлено высоким уровнем их полиморфизма.</p></sec><sec><title>Методы</title><p>Методы. Материалом для генетической экспертизы служила криоконсервированная сперма быков-производителей, принадлежащих РГУСП «Коми» по племенной работе (г. Сыктывкар). Для анализа были отобраны образцы от 64 чистопородных холмогорских и 36 с различным уровнем голштинизации быков-производителей. Аллельную структуру STR-маркеров определяли в лаборатории ДНК-технологий ФГБНУ «ВНИИплем». Генетический и статистический анализ проведен по общепринятым в биологии и зоотехнии методикам.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. Среди чистопородных быков выявлены 9 приват-аллелей, а у помесных производителей — 13. Наиболее полиморфными среди голштинизированных животных были локусы TGLA122 (Na = 10) и TGLA227 (Na = 11), у чистопородных — TGLA227 (Na = 9) и TGLA53 (Na = 10). Максимальное соответствие числа фактических и эффективных аллелей наблюдалось по локусу BM1824, а минимальное — по TGLA227. Индекс Шеннона был максимальный по локусу TGLA122 (2,046) у помесных и по TGLA53 (2,011) у чистопородных быков, а наименьший — по BM1818 (1,050 и 1,174). Разнообразность аллелофонда анализируемых локусов у метизированных животных была незначительно выше (на 0,26). Средний индекс фиксации у помесей отклонялся в сторону незначительного дефицита гетерозиготности (0,017), а у чистопородных быков — избытка (-0,025). Наибольшее генетическое родство между двумя выборками наблюдалось по локусу SPS115 (0,996), а наименьшее — по CSSM66 (0,827).</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Relevance</title><p>Relevance. Due to widespread metisation the Kholmogorskaya breed is on the verge of complete extinction, which requires the development of measures aimed at preserving not only the animals themselves, but also their genetic diversity. Microsatellites can be considered the most convenient for analyzing the genetic state of a population, due to the high level of their polymorphism.</p></sec><sec><title>Methods</title><p>Methods. The material for genetic examination was cryocon-served sperm of bulls-producers belonging to the RSUP «Komi» for breeding work (Syktyvkar). Samples from 64 pure-bred Kholmogorsky and 36 with different levels of Holstein breeding bulls were selected for analysis. The allelic structure of STR markers was determined in the laboratory of DNA technologies of FGBNU «VNIIplem». The genetic and statistical analysis was carried out according to the methods generally accepted in biology and animal science.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. Among purebred bulls 9 privat-alleles were identified, and in crossbreed producers — 13. The most polymorphic among Holstein animals were loci TGLA122 (Na = 10) and TGLA227 (Na = 11), in purebred animals — TGLA227 (Na = 9) and TGLA53 (Na = 10). The maximum correspondence between the number of actual and effective alleles was observed at the BM1824 locus, and the minimum at TGLA227. The Shannon index was the highest for the locus TGLA122 (2,046) in crossbreeds and for TGLA53 (2,011) in purebred bulls, and the lowest for BM1818 (1,050 and 1,174). The diversity of the allelofund of the analyzed loci in the metalized animals was slightly higher (by 0.26). The average fixation index in crossbreeds deviated towards a slight deficit of heterozygosity (0.017), and in purebred bulls an excess (-0.025). The greatest genetic relationship between the two samples was observed at the SPS115 locus (0.996), and the smallest at CSSM66 (0.827).</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>холмогорская порода</kwd><kwd>голштинизированные помеси</kwd><kwd>аллелофонд</kwd><kwd>микросателлиты</kwd><kwd>полиморфизм</kwd><kwd>генетическое разнообразие</kwd><kwd>индекс фиксации</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Kholmogorsky breed</kwd><kwd>Holstein crossbreeds</kwd><kwd>allelofund</kwd><kwd>microsatellites</kwd><kwd>polymorphism</kwd><kwd>genetic diversity</kwd><kwd>fixation index</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Исследования выполнены в рамках государственного задания Минобрнауки России № FGMW 2019-0051 и проекта межрегионального научно-образовательного центра мирового уровня «Российская Арктика: новые материалы, технологии и методы исследования».</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The research was carried out within the framework of the state assignment of the Ministry of Education and Science of the Russian Federation No. FGMW 2019-0051 and the project of the interregional world-class scientific and educational center «Russian Arctic: new materials, technologies and research methods».</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Матюков В.С., Тырина Ю.О., Кантанен Ю., Столповский Ю.А. О генетических особенностях и селекционной ценности местного скота (на примере холмогорской породы). Сельскохозяйственная биология. 2013; 48(2): 19–30. https://elibrary.ru/pzaxlp</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Matyukov V.S., Tyrina Yu.O., Kantanen Yu., Stolpovskii Yu.A. About features and selective value of the gene pool in local cattle (for Kholmogory breed as an example). Agricultural biology. 2013; 48(2): 19–30 (In Russian). https://elibrary.ru/pzaxlp</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Матюков В.С. Еще раз о генофонде и селекции холмогорского скота. Монография. Сыктывкар. 2007; 139. ISBN 978-5-7934-0208-8 https://elibrary.ru/qkzbrz</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Matyukov V.S. Once again about the gene pool and breeding of Kholmogorsky cattle. Monograph. Syktyvkar. 2007; 139 (In Russian). ISBN 978-5-7934-0208-8 https://elibrary.ru/qkzbrz</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Прожерин В.П., Ялуга В.Л., Рухлова Т.А., Кувакина И.В., Хуснутдинова Е.Д. Система селекционно-племенной работы с холмогорской породой крупного рогатого скота в Архангельской области на 2014–2019 годы. Архангельск. 2014; 122. ISBN 978-5-7536-0430-9 https://www.elibrary.ru/trdrsf</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Prozherin V.P., Yaluga V.L., Rukhlova T.A., Kuvakina I.V., Khusnutdinova E.D. The system of selection and breeding work with the Kholmogorsky breed of cattle in the Arkhangelsk region for 2014–2019. Arkhangelsk. 2014; 122 (In Russian). ISBN 978-5-7536-0430-9 https://www.elibrary.ru/trdrsf</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Николаев С.В., Шемуранова Н.А. Продуктивность коров холмогорской породы с различной степенью голштинизации в условиях Республики Коми. Молочное и мясное скотоводство. 2020; (2): 19–23. https://doi.org/10.33943/MMS.2020.82.49.005</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nikolaev S.V., Shemuranova N.A. Productivity of cows of the kholmogorskaya breed with varying degrees of holstein in the Komi Republic. Dairy and Beef Cattle Farming. 2020; (2): 19–23 (In Russian). https://doi.org/10.33943/MMS.2020.82.49.005</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Прожерин В.П., Ялуга В.Л., Калашникова Л.А. Проблемы сохранения отечественных пород молочного скота. Зоотехния. 2016; (9): 2–4. https://www.elibrary.ru/wmwmyr</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Prozherin V.P., Yaluga V.L., Kalashnikova L.A. Gene pool preservation problems of Russian dairy cattle breeds. Zootechniya. 2016; (9): 2–4 (In Russian). https://www.elibrary.ru/wmwmyr</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Паронян И.А. Возможности сохранения и совершенствования генофонда пород крупного рогатого скота отечественной селекции. Достижения науки и техники АПК. 2018; (5): 63–66. https://doi.org/10.24411/0235-2451-2018-10516</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Paronyan I.A. Possibilities of preservation and improvement of the gene pool of cattle of domestic breeding. Achievements of Science and Technology of AIC. 2018; (5): 63–66 (In Russian). https://doi.org/10.24411/0235-2451-2018-10516</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Матюков В.С., Жариков Я.А., Лобов Д.В. Сохранить холмогорскую породу — основу органического сельского хозяйства на Севере. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2019; 55: 63–69. https://doi.org/10.24411/2078-1318-2019-12063</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Matyukov V.S., Zharikov Ya.A., Lobov D.V. Preserve the Kholmogorsky breed — the basis of organic agriculture in the North. Izvestiya Saint-Petersburg State Agrarian University. 2019; 55: 63–69 (In Russian). https://doi.org/10.24411/2078-1318-2019-12063</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Матюков В.С., Жариков Я.А., Зиновьева Н.А. Генетическая история и ценность генофонда исчезающей холмогорской породы. Молочное и мясное скотоводство. 2018; (2): 2–8. https://www.elibrary.ru/xmgyeh</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Matyukov V.S., Zharikov Ya.A., Zinovieva N.A. Genetic history and value of the gene pool appearing Holmogosky breed. Journal of Dairy and Beef Cattle Breeding. 2018; (2): 2–8 (In Russian). https://www.elibrary.ru/xmgyeh</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Николаев С.В., Конопельцев И.Г., Матюков В.С. Воспроизводительные качества коров холмогорской породы в сравнении с другими породами скота молочного направления в Республике Коми. Современные научно-практические достижения в ветеринарии. Сборник статей Международной научно-практической конференции. Киров: Вятская государственная сельскохозяйственная академия. 2019; 10: 52–56. https://www.elibrary.ru/kasjel</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nikolaev S.V., Konopel’tsev I.G., Matyukov V.S. Reproducible qualities of cows of the Kholmogorsky breed in comparison with other breeds of dairy cattle in the Komi Republic. Modern scientific and practical achievements in veterinary medicine. Proceedings of the International scientific and practical conference. Kirov: Vyatka State Agrotechnological University. 2019; 10: 52–56 (In Russian). https://www.elibrary.ru/kasjel</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Кузнецов В.М. Сравнение методов оценки генетической дифференциации популяций по микросателлитным маркерам. Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2020; 21(2): 169–182. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2020.21.2.169-182</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuznetsov V.M. Comparison of methods for evaluating genetic differentiation of populations by microsatellite markers. Agricultural Science Euro-NorthEast. 2020; 21(2): 169–182 (In Russian). https://doi.org/10.30766/2072- 9081.2020.21.2.169-182</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Radko A., Rychlik T. Use of blood group tests and microsatellite DNA markers for parentage verification in a population of Polish Red-and-White cattle. Annals of Animal Science. 2009; 9(2): 119–125.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Radko A., Rychlik T. Use of blood group tests and microsatellite DNA markers for parentage verification in a population of Polish Red-and-White cattle. Annals of Animal Science. 2009; 9(2): 119–125.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Dotsev A.V. et al. Microsatellite-based heterozygosity fitness correlations in reindeer. Journal of Animal Science. 2019; 97(S3): 266. https://doi.org/10.1093/jas/skz258.541</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Dotsev A.V. et al. Microsatellite-based heterozygosity fitness correlations in reindeer. Journal of Animal Science. 2019; 97(S3): 266. https://doi.org/10.1093/jas/skz258.541</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Van de Goor L.H.P., Panneman H., Van Haeringen W.A. A proposal for standardization in forensic bovine DNA typing: allele nomenclature of 16 cattlespecific short tandem repeat loci. Animal Genetics. 2009; 40(5): 630–636. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2009.01891.x</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Van de Goor L.H.P., Panneman H., Van Haeringen W.A. A proposal for standardization in forensic bovine DNA typing: allele nomenclature of 16 cattlespecific short tandem repeat loci. Animal Genetics. 2009; 40(5): 630–636. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2009.01891.x</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
