Николаев Семён Викторович - кандидат ветеринарных наук, заведующий лабораторией северного оленеводства.
ул. им. Малыгина, 86, Тюмень, 625026
Semyon V. Nikolaev - Candidate of Veterinary Sciences, Head of the Laboratory of Reindeer Husbandry.
86 Malygin Str., Tyumen, 625026
Матюков Валерий Самуилович - кандидат биологических наук, научный сотрудник.
ул. им. Малыгина, 86, Тюмень, 625026
Valery S. Matyukov - Candidate of Biological Sciences, Researcher Associate.
86 Malygin Str., Tyumen, 625026
Филатов Андрей Викторович - доктор ветеринарных наук, научный сотрудник.
ул. им. Малыгина, 86, Тюмень, 625026
Andrey V. Filatov - Doctor of Veterinary Sciences, Researcher Associate.
86 Malygin Str., Tyumen, 625026
Актуальность. Повышение рентабельности северного оленеводства возможно путем внедрения современных методов ведения селекционно-племенной работы, в том числе основанного на популяционно-генетическом анализе.
Методы. Полиморфизм микросателлитов по 16 локусам у северных оленей ненецкой породы (n = 100) изучали с использованием набора COrDIS Reindeer. В программе Structure 2.3.4. генотипированных животных разделили на кластеры и по вероятности генетического соответствия объединили в группы. По каждой группе провели оценку основных генетических параметров, рассчитали степень генетического сходства между кластерами (k) и популяцией (Pop) в целом.
Результаты. Максимальное количество наблюдаемых и эффективных STR-аллелей установили в k5 (6,188 и 3,903 соответственно). По величине индекса Шеннона минимальным генетическим разнообразием (I = 1,202) характеризовался первый кластер, пятый — напротив, максимальным (I = 1,414). По k1, k4 и k5 установлен незначительный избыток гетерозигот (-0,061–0,029), а в целом по популяции отмечалась их небольшая редукция (Fis = 0,017). У особей k1 выявлены приват-аллели Rt6186 и C276259 с суммарной частотой 0,060, характерные для k2 микросателлиты Rt7240 и FCB193138 встречались с общей частотой 0,079, в k4 суммарная частота встречаемости приват-аллелей Rt1267, BMS745330, NVHRT16142 составила 0,100, в k5 приват-аллели BMS1788150, Rt30223, Rt7254, OheQ299, Rt24248 обнаружили у 21,9% животных. Генетическая дистанция (DN) была минимальной между k2 и k4 (0,043), максимальной — между k2 и k3 (0,119). По отношению к популяции в целом максимальная генетическая дистанция прослеживалась у k3 (DN = 0,049), а наименьшая — у k2 (DN = 0,025). Самая высокая оценка по Dest-статистике получена при сравнении пар Pop-k1 и Pop-k3 (Dest = 0,021) и отсутствовала между Pop-k2 и Pop-k5 (Dest = -0,004–0,002).
Relevance. Increasing the profitability of reindeer husbandry is possible through the introduction of modern methods of conducting breeding work, including using population genetic analysis.
Methods. The DNA of Nenets reindeer (n = 100) was studied with respect to 16 microsatellite markers using the COrDIS Reindeer kit. Based on genetic similarity, in the Structure 2.3.4 program, animals were divided into clusters, in each of which the main genetic parameters were evaluated, as well as the degree of genetic similarity between clusters (k) and the population (Pop) as a whole was calculated.
Results. It was found that the maximum number of observed and effective microsatellites was present in k5 (6,188 and 3,903, respectively). The first cluster was characterized by a lower genetic diversity (I = 1,202), the fifth — on the contrary, the maximum (I = 1,414). For k1, k4 and k5, there was a slight deviation towards an excess of heterozygotes (-0.061–0.029), and in general, a slight shift towards an increase in inbreeding was noted for Pop (Fis = 0.017). Private alleles Rt6186 and C276259 with a total frequency of 0.060 were detected in k1, Rt7240 and FCB193138 with a total prevalence of 0.079 in k2, the occurrence of private alleles Rt1267, BMS745330, NVHRT16142 was 0.100 in k4, and specific microsatellites in k5 BMS1788150, Rt30223, Rt7254, OheQ299, Rt24248 were found in 21.9% of animals. The genetic distance (DN) was minimal between k2 and k4 (0.043), and maximal between k2 and k3 (0.119). In relation to Pop, the maximum distance was viewed to k3 (DN = 0.049), and the smallest to k2 (DN = 0.025). The most noticeable true allelic differentiation was observed between Pop-k1 and Pop-k3 samples (Dest = 0.021), and there was no gap between Pop-k2 and Pop-k5 (Dest = -0.004–0.002).
The authors declare that there are no conflicts of interest present.