vetpressАграрная наукаAgrarian science0869-81552686-701XРедакция журнала "Аграрная наука"10.32634/0869-8155-2025-400-11-68-75vetpress-3895Research ArticleЗООТЕХНИЯZOOTECHNICSИдентификация SNP и генов-кандидатов, ассоциированных с массой первого яйца у кур-несушек на основе данных полногеномного генотипированияIdentification of SNPs and candidate genes associated with first egg weight in laying hens based on whole-genome genotyping datahttps://orcid.org/0000-0001-7191-3550ВолковаН. А.VolkovaN. A.

 Наталья Александровна Волкова,  доктор биологических наук, главный научный сотрудник, руководитель лаборатории криобиологии   пос. Дубровицы, 60, Подольск, Московская обл., 142132 

 Natalia Alexandrovna Volkova,  Doctor of Biological Sciences, Chief Researcher, Head of the Cryobiology Laboratory

60 Dubrovitsy, Podolsk Municipal District, Moscow Region,142132 

natavolkova@inbox.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2865-5960ВетохА. Н.VetokhA. N.

 Анастасия Николаевна Ветох,  научный сотрудник лаборатории криобиологии

 пос. Дубровицы, 60, Подольск, Московская обл., 142132   

 Anastasia Nikolaevna Vetokh,  Reasearcher at the Cryobiology Laboratory

60 Dubrovitsy, Podolsk Municipal District, Moscow Region,142132

anastezuya@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-9407-3686ВолковаЛ. А.VolkovaL. A.

 Людмила Александровна Волкова,  кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории микробиологии

 пос. Дубровицы, 60, Подольск, Московская обл., 142132 

 Ludmila Alexandrovna Volkova,  Candidate of Biological Sciences, Researcher of the Microbiology Laboratory

60 Dubrovitsy, Podolsk Municipal District, Moscow Region,142132 

ludavolkova@inbox.ruФедеральный исследовательский центр животноводства — ВИЖ им. академика Л.К. ЭрнстаРоссияL.K. Ernst Federal Research Center for Animal HusbandryRussian Federation2025191120250116875Copyright © Волкова Н.А., Ветох А.Н., Волкова Л.А., 20252025Волкова Н.А., Ветох А.Н., Волкова Л.А.Volkova N.A., Vetokh A.N., Volkova L.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.vetpress.ru/jour/article/view/3895

Поиск генетических маркеров, детерминирующих формирование и степень проявления перспективных фенотипов селекционно значимых признаков у кур, является одной из приоритетных задач геномной селекции, направленной на повышение и реализацию их продуктивного потенциала.Цели исследований — поиск и идентификация однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и генов-кандидатов, ассоциированных с массой первого яйца у кур-несушек на основе данных полногеномного генотипирования.Объектом исследований являлись куры F2 ресурсной популяции, полученной посредством межпородного скрещивания двух контрастных по яичной продуктивности пород — русской белой и корниш (n = 94). Особей оценивали по массе первого яйца в начале яйцекладки. Для полногеномного генотипирования кур F2 использовали ДНК-чип Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip. На основании полученных данных фенотипа и генотипа проводили полногеномные ассоциативные исследования.Выявлены 7 достоверно значимых SNP (p < 1,06 х 10-5), ассоциированных с массой первого яйца у кур F2 ресурсной популяции. В области данных SNP идентифицированы 26 генов, в том числе в позициях SNP — 3 гена (MPP7, SNTG1, SEPTIN11). Установлено, что генотипы GG по локусу Gga_rs15141739 (ген SNTG1) и АА по локусу GGaluGA162050 детерминируют более высокую массу первого яйца у кур (р < 0,01).

The search for genetic markers and their identification that determine the formation and degree of manifestation of promising phenotypes for economically important traits in chickens is one of the priority tasks of genomic selection.The research objectives are to search for and identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) and candidate genes associated with the weight of the first egg in laying hens based on genome—wide genotyping data.The object of the study was F2 hens of the resource population obtained by interbreeding two breeds with contrasting egg productivity — Russian White and Cornish (n = 94). F2 individuals were assessed by the weight of the first egg at the beginning of laying. For whole-genome genotyping of F2 hens, the Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip DNA chip was used.Based on the obtained phenotype and genotype data, whole-genome association studies were performed. Seven significant SNPs (p < 1.06 x 10-5) associated with the first egg weight in F2 resource population hens were identified. The 26 genes were identified in the SNP data area, including 3 genes in SNP positions (MPP7, SNTG1, SEPTIN11). It was established that genotypes GG at the Gga_rs15141739 locus (SNTG1) and AA at the GGaluGA162050 locus cause a high weight of the first egg (p < 0.01).

курымасса яйцаSNPгены-кандидатыGWASchickenegg weightSNPcandidate genesGWASРабота выполнена при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования РФ (тема № FGGN-2024-0015).This research was supported financially by the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation (subject No. FGGN-2024-0015).ReferencesБуяров А.В., Буяров В.С. Роль отрасли птицеводства в обеспечении продовольственной безопасности России. Вестник Курской государственной сельскохозяйственной академии. 2020; (7): 84‒95. https://www.elibrary.ru/uuutfrBuyarov A.V., Buyarov V.S. The role of the poultry industry in ensuring food security in Russia. Vestnik of Kursk State Agricultural Academy. 2020; (7): 84‒95 (in Russian). https://www.elibrary.ru/uuutfrЧернявская С.А., Лебедев С.А., Чумаченко Е.М. Анализ динамики развития птицеводства в регионах России и его роль в обеспечении продовольственной безопасности. Журнал прикладных исследований. 2025; (4): 66‒74. https://www.elibrary.ru/ucbfynChernyavskaya S.A., Lebedev S.A., Chumachenko E.M. Analysis of the dynamics of poultry farming in the regions of Russia and its role in ensuring food security. Journal of Applied Research. 2025; (4): 66–74 (in Russian). https://www.elibrary.ru/ucbfynКозерод Ю.М., Воробьева Н.В. Особенности и тенденции развития яичного птицеводства России на современном этапе. Экономика, труд, управление в сельском хозяйстве. 2024; 7(113): 188–194. https://doi.org/10.33938/247-188Kozerod Yu.M., Vorobyova N.V. Features and trends in the development of egg poultry farming in Russia at the present stage. Economy, labor, management in agriculture. 2024; 7(113): 188–194 (in Russian). https://doi.org/10.33938/247-188Баюров Л.И., Гвоздева Ю.М. Состояние и перспективы развития птицеводства яичного направления. Современные проблемы в животноводстве: состояние, решения, перспективы. Сборник статей по материалам II Международной научнопрактической конференции, посвященной 90-летию академика В.Г. Рядчикова. Краснодар: Кубанский государственный аграрный университет им. И.Т. Трубилина. 2024; 319–325. https://www.elibrary.ru/pwamxoBayurov L.I., Gvozdeva Yu.M. State and prospects for the development of egg poultry farming. Modern problems in animal husbandry: status, solutions, prospects. Collection of articles based on the materials of the II International scientific and practical conference dedicated to the 90th anniversary of Academician V.G. Ryadchikov. Krasnodar: Kuban State Agrarian University named after I.T. Trubilin. 2024; 319–325 (in Russian). https://www.elibrary.ru/pwamxoТюменцева В.С., Попов П.А., Бабунова В.С., Савинова Е.П., Осипова И.С. Бактериальная обсемененность товарного куриного яйца. Аграрная наука. 2025; (4): 63–68. https://doi.org/10.32634/0869-8155-2025-393-04-63-68Tyumentseva V.S., Popov P.A., Babunova V.S., Savinova E.P., Osipova I.S. Bacterial contamination of commercial chicken eggs. Agrarian science. 2025; (4): 63–68 (in Russian). https://doi.org/10.32634/0869-8155-2025-393-04-63-68Гвоздева Ю.М. Экстерьерные и интерьерные маркеры потенциальной продуктивности птицы. Современные векторы развития науки. Сборник статей по материалам Ежегодной научно-практической конференции преподавателей по итогам НИР за 2023 год. Краснодар: Кубанский государственный аграрный университет им. И.Т. Трубилина. 2024; 267–268. https://www.elibrary.ru/brrpheGvozdeva Yu.M. Exterior and interior markers of potential poultry productivity. Modern vectors of scientific development. Collection of articles based on the materials of the annual scientific and practical conference of teachers on the results of research for 2023. Krasnodar: Kuban State Agrarian University named after I.T. Trubilin. 2024; 267–268 (in Russian). https://www.elibrary.ru/brrpheБуяров А.В., Воронцова Е.В. Производство яиц и мяса птицы: тренды, проблемы, перспективы развития. Актуальные проблемы ветеринарии и интенсивного животноводства. Сборник трудов Международной научно-практической конференции. Брянск: Брянский государственный аграрный университет. 2024; 29–36. https://www.elibrary.ru/ibstlfBuyarov A.V., Vorontsova E.V. Production of eggs and poultry meat: trends, problems, development prospects. Actual problems of veterinary science and intensive animal husbandry: Collection of papers of the international scientific and practical conference. Bryansk: Bryansk State Agrarian University. 2024; 29–36 (in Russian). https://www.elibrary.ru/ibstlfChomchuen K., Tuntiyasawasdikul V., Chankitisakul V., Boonkum W. Genetic Evaluation of Body Weights and Egg Production Traits Using a Multi-Trait Animal Model and Selection Index in Thai Native Synthetic Chickens (Kaimook e-san2). Animals. 2022; 12(3): 335. https://doi.org/10.3390/ani12030335Chomchuen K., Tuntiyasawasdikul V., Chankitisakul V., Boonkum W. Genetic Evaluation of Body Weights and Egg Production Traits Using a Multi-Trait Animal Model and Selection Index in Thai Native Synthetic Chickens (Kaimook e-san2). Animals. 2022; 12(3): 335. https://doi.org/10.3390/ani12030335Обожина Е.П., Чепуштанова О.В. Яичное направление сельскохозяйственных птиц. Приоритетные направления развития аграрной науки и технологий. Сборник тезисов научнопрактической конференции, посвященной 75-летнему юбилею факультета биотехнологии и пищевой инженерии. Екатеринбург: Уральский государственный аграрный университет. 2024; 290–291. https://www.elibrary.ru/kxsonuObozhina E.P., Chepushtanova O.V. Egg production of agricultural poultry. Priority areas for the development of agricultural science and technology. Collection of abstracts of the scientific and practical conference dedicated to the 75th anniversary of the Faculty of Biotechnology and Food Engineering. Ekaterinburg: Ural State Agrarian University. 2024; 290–291 (in Russian). https://www.elibrary.ru/kxsonuКавтарашвили А.Ш. Куриное яйцо. Часть 2. Факторы, влияющие на массу яиц. Наше сельское хозяйство. 2024; 16(336): 65–67. https://www.elibrary.ru/fjzwxuKavtarashvili A.Sh. Chicken egg. Part 2. Factors influencing egg weight. Nashe sel’skoye khozyaystvo (Our agriculture). 2024; 16(336): 65–67 (in Russian). https://www.elibrary.ru/fjzwxuЛосевская С.А., Ильин В.Г. Категории яиц, их характеристики и способы хранения. Материалы Всероссийской (национальной) научно-практической конференции с международным участием, посвященной 110-летию со дня рождения И.С. Кауричева. Материалы конференции. Калуга: ИП Якунина В.А. 2024; 59–61. https://www.elibrary.ru/cjpjxhLosevskaya S.A., Ilyin V.G. Egg categories, their characteristics and storage methods. Proceedings of the All-Russian (national) scientific and practical conference with international participation dedicated to the 110th anniversary of the birth of I.S. Kaurichev. Conference materials. Kaluga: individual entrepreneur Yakunina V.A. 2024; 59–61 (in Russian). https://www.elibrary.ru/cjpjxhАржанкова Ю.В., Прирезова Е.А. Сравнительная оценка куриных яиц разных категорий. Современное состояние и инновационные пути развития агропромышленного комплекса в РФ. Материалы Международной научно-практической конференции, посвященной Дню науки. Великие Луки: Великолукская государственная сельскохозяйственная академия. 2025; 9–15. https://www.elibrary.ru/cjqrbfArzhankova Yu.V., Prirezova E.A. Comparative assessment of chicken eggs of different categories. Current state and innovative ways of development of the agro-industrial complex in the Russian Federation. Proceedings of the International scientific and practical conference dedicated to the Day of Science. Velikiye Luki: Velikiye Luki State Agricultural Academy. 2025; 9–15 (in Russian). https://www.elibrary.ru/cjqrbfNangsuay A., Ruangpanit Y., Meijerhof R., Attamangkune S. Yolk absorption and embryo development of small and large eggs originating from young and old breeder hens. Poultry Science. 2011; 90(11): 2648‒2655. https://doi.org/10.3382/ps.2011-01415Nangsuay A., Ruangpanit Y., Meijerhof R., Attamangkune S. Yolk absorption and embryo development of small and large eggs originating from young and old breeder hens. Poultry Science. 2011; 90(11): 2648‒2655. https://doi.org/10.3382/ps.2011-01415Fathi M., Abou-Emera O., Al-Homidan I., Galal A., Rayan G. Effect of genotype and egg weight on hatchability properties and embryonic mortality pattern of native chicken populations. Poultry Science. 2022; 101(11): 102129. https://doi.org/10.1016/j.psj.2022.102129Fathi M., Abou-Emera O., Al-Homidan I., Galal A., Rayan G. Effect of genotype and egg weight on hatchability properties and embryonic mortality pattern of native chicken populations. Poultry Science. 2022; 101(11): 102129. https://doi.org/10.1016/j.psj.2022.102129Шаповалов С.О., Буряков Н.П., Корнилова Е.B., Жевнеров А.В., Алтухов Т.Д., Аникина Д.С. Мониторинг качества инкубационного яйца мясных кроссов импортного и отечественного производства. Аграрная наука. 2024; (12): 89–97. https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-389-12-89-97Shapovalov S.O., Buryakov N.P., Kornilova E.V., Zhevnerov A.V., Altukhov T.D., Anikina D.S. Monitoring the quality of incubation eggs of meat crosses of imported and domestic production. Agrarian science. 2024; (12): 89–97 (in Russian). https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-389-12-89-97Ni A. et al. Genetic parameters, reciprocal cross differences, and age-related heterosis of egg-laying performance in chickens. Genetics Selection Evolution. 2023; 55: 87. https://doi.org/10.1186/s12711-023-00862-7Ni A. et al. Genetic parameters, reciprocal cross differences, and age-related heterosis of egg-laying performance in chickens. Genetics Selection Evolution. 2023; 55: 87. https://doi.org/10.1186/s12711-023-00862-7Fu M. et al. Genome-Wide Association Study of Egg Production Traits in Shuanglian Chickens Using Whole Genome Sequencing. Genes. 2023; 14(12): 2129. https://doi.org/10.3390/genes14122129Fu M. et al. Genome-Wide Association Study of Egg Production Traits in Shuanglian Chickens Using Whole Genome Sequencing. Genes. 2023; 14(12): 2129. https://doi.org/10.3390/genes14122129Lordelo M., Cid J., Cordovil C.M.D.S., Alves S.P., Bessa R.J.B., Carolino I. A comparison between the quality of eggs from indigenous chicken breeds and that from commercial layers. Poultry Science. 2020; 99(3): 1768–1776. https://doi.org/10.1016/j.psj.2019.11.023Lordelo M., Cid J., Cordovil C.M.D.S., Alves S.P., Bessa R.J.B., Carolino I. A comparison between the quality of eggs from indigenous chicken breeds and that from commercial layers. Poultry Science. 2020; 99(3): 1768–1776. https://doi.org/10.1016/j.psj.2019.11.023Grela E.R., Knaga S., Winiarska-Mieczan A., Zięba G. Effects of dietary alfalfa protein concentrate supplementation on performance, egg quality, and fatty acid composition of raw, freeze-dried, and hardboiled eggs from Polbar laying hens. Poultry Science. 2020; 99: 2256–2265. https://doi.org/10.1016/j.psj.2019.11.030Grela E.R., Knaga S., Winiarska-Mieczan A., Zięba G. Effects of dietary alfalfa protein concentrate supplementation on performance, egg quality, and fatty acid composition of raw, freeze-dried, and hardboiled eggs from Polbar laying hens. Poultry Science. 2020; 99: 2256–2265. https://doi.org/10.1016/j.psj.2019.11.030Ketta M., Tůmová E. Eggshell structure, measurements, and quality-affecting factors in laying hens: a review. Czech Journal of Animal Science. 2016; 61(7): 299–309. https://doi.org/10.17221/46/2015-CJASKetta M., Tůmová E. Eggshell structure, measurements, and quality-affecting factors in laying hens: a review. Czech Journal of Animal Science. 2016; 61(7): 299–309. https://doi.org/10.17221/46/2015-CJASRizzi C. A Study on Egg Production and Quality According to the Age of Four Italian Chicken Dual-Purpose Purebred Hens Reared Outdoors. Animals. 2023; 13(19): 3064. https://doi.org/10.3390/ani13193064Rizzi C. A Study on Egg Production and Quality According to the Age of Four Italian Chicken Dual-Purpose Purebred Hens Reared Outdoors. Animals. 2023; 13(19): 3064. https://doi.org/10.3390/ani13193064Gao J. et al. Genome-Wide Association Study of Egg-Laying Traits and Egg Quality in LingKun Chickens. Frontiers in Veterinary Science. 2022; 9: 877739. https://doi.org/10.3389/fvets.2022.877739Gao J. et al. Genome-Wide Association Study of Egg-Laying Traits and Egg Quality in LingKun Chickens. Frontiers in Veterinary Science. 2022; 9: 877739. https://doi.org/10.3389/fvets.2022.877739Haqani M.I. et al. Quantitative trait loci for growth-related traits in Japanese quail (Coturnix japonica) using restriction-site associated DNA sequencing. Molecular Genetics and Genomics. 2021; 296(5): 1147–1159. https://doi.org/10.1007/s00438-021-01806-wHaqani M.I. et al. Quantitative trait loci for growth-related traits in Japanese quail (Coturnix japonica) using restriction-site associated DNA sequencing. Molecular Genetics and Genomics. 2021; 296(5): 1147–1159. https://doi.org/10.1007/s00438-021-01806-wSchreiweis M.A., Hester P.Y., Settar P., Moody D.E. Identification of quantitative trait loci associated with egg quality, egg production, and body weight in an F2 resource population of chickens. Animal Genetics. 2006; 37(2): 106–112. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2005.01394.xSchreiweis M.A., Hester P.Y., Settar P., Moody D.E. Identification of quantitative trait loci associated with egg quality, egg production, and body weight in an F2 resource population of chickens. Animal Genetics. 2006; 37(2): 106–112. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2005.01394.xAslam M.L., Bastiaansen J.W.M., Crooijmans R.P.M.A., Vereijken A., Groenen M.A.M. Whole genome QTL mapping for growth, meat quality and breast meat yield traits in turkey. BMC Genetics. 2011; 12: 61. https://doi.org/10.1186/1471-2156-12-61Aslam M.L., Bastiaansen J.W.M., Crooijmans R.P.M.A., Vereijken A., Groenen M.A.M. Whole genome QTL mapping for growth, meat quality and breast meat yield traits in turkey. BMC Genetics. 2011; 12: 61. https://doi.org/10.1186/1471-2156-12-61Liao R. et al. Genome-wide association study reveals novel variants for growth and egg traits in Dongxiang blue-shelled and White Leghorn chickens. Animal Genetics. 2016; 47(5): 588–596. https://doi.org/10.1111/age.12456Liao R. et al. Genome-wide association study reveals novel variants for growth and egg traits in Dongxiang blue-shelled and White Leghorn chickens. Animal Genetics. 2016; 47(5): 588–596. https://doi.org/10.1111/age.12456Jin C.F., Chen Y.J., Yang Z.Q., Shi K., Chen C.K. A genomewide association study of growth trait-related single nucleotide polymorphisms in Chinese Yancheng chickens. Genetics and Molecular Research. 2015; 14(4): 15783–15792.Jin C.F., Chen Y.J., Yang Z.Q., Shi K., Chen C.K. A genomewide association study of growth trait-related single nucleotide polymorphisms in Chinese Yancheng chickens. Genetics and Molecular Research. 2015; 14(4): 15783–15792.Wolc A. et al. Genetic parameters of egg defects and egg quality in layer chickens. Poultry Science. 2012; 91(6): 1292–1298. https://doi.org/10.3382/ps.2011-02130Wolc A. et al. Genetic parameters of egg defects and egg quality in layer chickens. Poultry Science. 2012; 91(6): 1292–1298. https://doi.org/10.3382/ps.2011-02130

The authors declare that there are no conflicts of interest present.