Семён Викторович Николаев, кандидат ветеринарных наук, заведующий лабораторией северного оленеводства
ул. им. Малыгина, 86, Тюмень, 625026
Semyon Viktorovich Nikolaev, Candidate of Veterinary Sciences, Head of the Laboratory of Reindeer Husbandry
86 Malygin Str., Tyumen, 625026
Андрей Викторович Филатов, доктор ветеринарных наук, научный сотрудник
ул. им. Малыгина, 86, Тюмень, 625026
Andrey Viktorovich Filatov, Doctor of Veterinary Sciences, Research Associate
86 Malygin Str., Tyumen, 625026
Актуальность. Исследования в области популяционной генетики являются одним из основных инструментов для формирования стратегии селекционно-племенной работы и повышения экономической эффективности северного оленеводства.
Методы. Объектом исследования являлись северные олени Республики Коми (PSK, n = 100) и Ямало-Ненецкого автономного округа (ЯНАО) (YOS, n = 100). Для генетического анализа использовали выщипы из ушной раковины и пантов. Генотип животных определяли по 16 микросателлитным маркерам с помощью тест-системы COrDIS Reindeer методом мультиплексной ПЦР. Статистический анализ выполнен в программе GenAlEx 6.503.
Результаты. Индекс Шеннона указывал на высокое аллельное разнообразие в локусах Rt1 (PSK) и OheQ (PSK, YOS), минимальное — в BMS745 и C276. Популяция PSK отличалась высокой наблюдаемой гетерозиготностью в Rt9 (0,940) и низкой — в C143 (0,430), а среди животных ЯНАО максимальные значения были в Rt1 и OheQ (0,880), минимальные — в C143 и C276 (0,350). Оценка индекса фиксации у оленей PSK выявила избыток гетерозиготности в Rt9 и Rt6, дефицит — в BMS1788, а у животных YOS избыток был в T40, дефицит — в C276. Популяция PSK имела более высокий запас гетерозиготности (0,040, р ≤ 0,05) по отношению к YOS. Комплексный анализ выявил 7 уникальных последовательностей у оленей PSK и 4 — у YOS. Частоты приватных аллелей составили 6% и 4% соответственно. Индекс фиксации Райта показал умеренную дивергенцию между популяциями в локусах BMS1788, Rt1, C143, C276 и C32, значительную дивергенцию — в BMS745. Оценки по Gst и Dest подтвердили полученные результаты. В целом популяция YOS оказалась менее генетически разнообразна по сравнению с PSK. Для снижения уровня инбридинга в стаде YOS необходимо организовать завоз производителей из других популяций.
Relevance. Research in the field of population genetics is one of the main tools for forming a breeding strategy and increasing the economic efficiency of reindeer husbandry.
Methods. The object of the study was the reindeer of the Komi Republic (PSK, n = 100) and the Yamalo-Nenets Autonomous Okrug (Yamalo-Nenets Autonomous Okrug) (YOS, n = 100). Plucks from the auricle and antlers were used for genetic analysis. The genotype of the animals was determined by 16 microsatellite markers using the COrDIS Reindeer multiplex PCR test system. The statistical analysis was performed in the GenAlEx 6.503 program.
Results. The Shannon index indicated high allelic diversity in Rt1 (PSK) and OheQ (PSK, YOS) loci, with minimal diversity in BMS745 and C276. The PSK population was characterized by high observed heterozygosity in Rt9 (0.940) and low in C143 (0.430), while among YamaloNenets Autonomous District animals, the maximum values were in Rt1 and OheQ (0.880), and the minimum values were in C143 and C276 (0.350). Assessment of the fixation index in PSK deer revealed an excess of heterozygosity in Rt9 and Rt6, a deficiency in BMS1788, and in YOS animals there was an excess in T40 and a deficiency in C276. The PSK population had a higher margin of heterozygosity (0.040, р < 0.05) relative to YOS. A comprehensive analysis revealed 7 unique sequences in PSK deer and 4 in YOS. The frequencies of private alleles were 6% and 4%, respectively. The Wright fixation index showed moderate divergence between populations at loci BMS1788, Rt1, C143, C276, and C32, and significant divergence at BMS745. The Gst and Dest scores confirmed these results. Overall, the YOS population turned out to be less genetically diverse compared to the PSK. To reduce the level of inbreeding in the YOS herd, it is necessary to organize the import of producers from other populations.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.