Изучение гена кислой хитиназы SE2 в генотипах сахарной свеклы
https://doi.org/10.32634/0869-8155-2021-348-4-88-90
Аннотация
Цель работы – апробация специфического праймера FusA1F/FusA1R для изучения гена SE2, ответственного за экспрессию кислой хитиназы при стрессовых ситуациях. Материалом для исследования служили растения сахарной свеклы отечественной и зарубежной селекции. Для подтверждения связи гена SE2, локализованного на хромосоме 3 и контролирующего стабильный уровень работы кислой хитинизы, с устойчивостью сахарной свеклы к корневой гнили проведено генотипирование 10 образцов сахарной свеклы с использованием молекулярного-генетического маркера FusA1. Были выявлены по 2 ДНК-фрагмента длиной 600 п.н. и 400 п.н. во всех исследуемых генотипах, кроме растений дикой свеклы (Beta corolliflora Zoss.). В результате проведенных исследований гена SE2 идентифицированы восемь однонуклеотидных замен (3 T/C, 2 C/G, A/G, G/A, C/T) и 3 однонуклеотидные вставки (нуклеотид А) в растениях селекционного номера 9 (Sh.1) по сравнению с устойчивым генотипом. Растения данного гибрида и в полевых условиях проявляли признаки зараженности фузариозом. Можно предположить, что данные SNPs могут приводить к преодолению устойчивости (путем замены аминокислотной единицы в полипептиде) и, как следствие, снижению адаптационной способности растений.
Об авторах
А. А. НалбандянРоссия
396030, РФ, Воронежская обл., Рамонский р-н, п. ВНИИСС, д. 86
А. С. Хуссейн
Россия
396030, РФ, Воронежская обл., Рамонский р-н, п. ВНИИСС, д. 86
Т. П. Федулова
Россия
396030, РФ, Воронежская обл., Рамонский р-н, п. ВНИИСС, д. 86
Т. С. Руденко
Россия
Н. Р. Михеева
Россия
396030, РФ, Воронежская обл., Рамонский р-н, п. ВНИИСС, д. 86
Г. А. Селиванова
Россия
396030, РФ, Воронежская обл., Рамонский р-н, п. ВНИИСС, д. 86
Список литературы
1. Kagami H., Kurata M., Matsuhira H. Sugar beet (Beta vulgaris L.). Methods Mol. Biol. 2015;1223: 335–347.
2. Стогниенко О.И., Стогниенко Е.С. Полевая устойчивость гибридов F1 сахарной свеклы к наиболее вредоносным болезням в условиях ЦЧР. Аграрная наука. 2019;2: P. 75–78.
3. Lucchi De C., Stevanato P., Hanson L., McGrath J., Panella L., Biaggi M. De, Broccanello C., Bertaggia M., Sella L., Concheri G. Molecular markers for improving control of soil-borne pathogen Fusarium oxysporum in sugar beet. Euphytica. 2017;213:71.
4. Francis S., Asher M. Exploitation of novel sources of disease resistance in Beta germplasm using molecular markers. J Sugar Beet. 2000;37: 89–95.
5. Fank A., Galewski P., McGrath M. Nucleotide-binding resistance gene signatures in sugar beet, insights from a new reference genome. The Plant Journal. 2018;95: 659-671.
6. Urbach J., Ausubel F. The NBS-LRR architectures of plant R-proteins and metazoan NLRs evolved in independent events. Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 2017;114: 1063-1068.
7. Sekhwal M, Pingchuan Li P, Lam I, Wang X, Cloutier S, You F. Disease Resistance Gene Analogs (RGAs) in Plants. Int. J. Mol. Sci. 2015;16: 19248-19290.
8. Yerzhebayeva R., Abekova A., Konysbekov K., Bastaubayeva Sh., Kabdrahkmanova A., Absattrova A., Shavrukov Y. Two sugar beet chitinase genes, BvSP2 and BvSE2, analysed with SNP Amplifluor-like markers, are highly expressed after Fusarium root rot inoculation and field susceptibility trial. Peer J. 2018;6: 2-19.
9. Nagpure A., Choudhary B., Gupta R. Chitinases: in agriculture and human healthcare. Critical Reviews in Biotechnology. 2014;34(3): 215-232.
10. Walker JC. Plant Pathology. Third Edition. New York: McGraw-Hill Book. 1969. 819 p.
11. Hussein A.S., Nalbandyan A.A., Fedulova T.P., Bogacheva N.N. Efficient and nontoxic DNA isolation method for PCR analysis. Russian Agricultural Sciences. 2014;40(3): 177-178.
12. Altschul S., Gish W., Miller W., Myers E. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 1990;215(3): 403–410.
Рецензия
Для цитирования:
Налбандян А.А., Хуссейн А.С., Федулова Т.П., Руденко Т.С., Михеева Н.Р., Селиванова Г.А. Изучение гена кислой хитиназы SE2 в генотипах сахарной свеклы. Аграрная наука. 2021;(4):88-90. https://doi.org/10.32634/0869-8155-2021-348-4-88-90
For citation:
Nalbandyan A.A., Hussein A.S., Fedulova T.P., Rudenko T.S., Mikheeva N.R., Selivanova G.A. Studying of the acid chitinase SE2 gene in sugar beet genotypes. Agrarian science. 2021;(4):88-90. (In Russ.) https://doi.org/10.32634/0869-8155-2021-348-4-88-90