Генетические особенности декоративных пород кур по однонуклеотидным заменам в гене LCORL

Актуальность. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) являются важными маркерами генетической изменчивости у кур, которые встречаются в геноме с высокой частотой. Идентификация и характеристика таких маркеров позволяют характеризовать породы с точки зрения их генетических особенностей. Цель данной работы — оценить полиморфизм в гене LCORL у декоративных пород кур на основе однонуклеотидных полиморфизмов.

Методы. Для проведения исследований были сформированы группы кур декоративных пород: новопавловская золотистая (n = 48), шелковая (n = 30), карликовый кохинхин (n = 30). С помощью метода ПЦР-ПДРФ анализировали участок гена LCORL по трем однонуклеотидным полиморфизмам (rs14491003, 236 G/T и 503A/G).

Результаты. По rs14491003 полиморфизм установлен только в популяции кур новопавловская золотистая, где 83,3% особей имели генотип СС. По SNP 236G/T только в выборке кур шелковой породы выявлены три возможных варианта генотипов, а частота аллеля G и Т была 46,7% и 53,3% соответственно. По SNP 503A/G во всех выборках птицы определены три генотипа гена LCORL. Для кур шелковой породы установлена высокая частота аллея А (71,7%), а для кур пород новопавловская золотистая и карликовый кохинхин — аллеля G (69,8% и 60,0% соответственно). При анализе частот аллелей по всем полиморфным SNP не выявлено сдвига генетического равновесия (χ2 ˂ 3,84). Полученные результаты свидетельствуют о том, что куры декоративных пород имеют породные особенности, обусловленные полиморфными вариантами гена LCORL, что подтверждает функциональную роль данного гена в процессах формирования и роста костей скелета у кур различного направления селекции.

1. Паронян И.А., Юрченко О.П., Вахрамеев А.Б., Макарова А.В. Разведение малочисленных и редких пород кур. Генетика и разведение животных. 2016; (4): 62‒66. https://elibrary.ru/xrurtx

2. Lawal R.A., Hanotte O. Domestic chicken diversity: Origin, distribution, and adaptation. Animal Genetics. 2021; 52(4): 385‒394. https://doi.org/10.1111/age.13091

3. Malomane D.K., Weigend S., Schmitt A.O., Weigend A., Reimer C., Simianer H. Genetic diversity in global chicken breeds in relation to their genetic distances to wild populations. Genetics Selection Evolution. 2021; 53: 36. https://doi.org/10.1186/s12711-021-00628-z

4. Jiang S. et al. Environmental adaptation and genetic insights: Cloning, bioinformatics, and tissue expression analysis of the LCORL gene in Guangxi Partridge Chicken. Chemosphere. 2024; 369: 143893. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2024.143893

5. Ларкина Т.А., Позовникова М.В., Вахрамеев А.Б., Федорова З.Л. Анализ экспрессии гена LCORL у кур русской белой породы в реперные точки роста и физиологического созревания. Молочнохозяйственный вестник. 2024; (4): 83‒99. https://elibrary.ru/fiilgn

6. Weikard R. et al. Metabolomic profiles indicate distinct physiological pathways affected by two loci with major divergent effect on Bos taurus growth and lipid deposition. Physiological Genomics. 2010; 42A(2): 79‒88. https://doi.org/10.1152/physiolgenomics.00120.2010

7. Dou T. et al. Genetic architecture and candidate genes detected for chicken internal organ weight with a 600 K single nucleotide polymorphism array. Asian-Australasian Journal of.Animal Sciences. 2018; 32(3): 341‒349. https://doi.org/10.5713/ajas.18.0274

8. Shen M. et al. A genome-wide study to identify genes responsible for oviduct development in chickens. PLoS ONE. 2017; 12(12): e0189955. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0189955

9. Дементьева Н.В., Ларкина Т.А., Митрофанова О.В., Федорова Е.С., Позднякова Т.Э. Связь однонуклеотидного полиморфизма в гене LCORL с продуктивными признаками кур. Птицеводство. 2019; (5): 14‒17. https://doi.org/10.33845/0033-3239-2019-68-5-14-17

10. Yi G. et al. Genome-wide association study dissects genetic architecture underlying longitudinal egg weights in chickens. BMC Genomics. 2015; 746: 16. https://doi.org/10.1186/s12864-015-1945-y

11. Wang J. et al. Elucidation of the genetic determination of body weight and size in Chinese local chicken breeds by large-scale genomic analyses. BMC Genomics. 2024; 25: 296. https://doi.org/10.1186/s12864-024-10185-6

12. Wang H. et al. Comparative population genomics analysis uncovers genomic footprints and genes influencing body weight trait in Chinese indigenous chicken. Poultry Science. 2023; 102(11): 103031. https://doi.org/10.1016/j.psj.2023.103031

13. Bai F. et al. LCORL and STC2 Variants Increase Body Size and Growth Rate in Cattle and Other Animals. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2025: qzaf025. https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzaf025

14. Ballan M. et al. Population genomic structures and signatures of selection define the genetic uniqueness of several fancy and meat rabbit breeds. Journal of.Animal Breeding and Genetics. 2023; 140(6): 663‒678. https://doi.org/10.1111/jbg.12818

15. Ларкина Т.А., Крутикова А.А., Пегливанян Г.К., Дементьева Н.В. Поиск полиморфных вариантов гена LCORL с помощью секвенирования по Сенгеру у пород кур различного направления продуктивности. Аграрный вестник Урала. 2020; (9): 48‒54. https://doi.org/10.32417/1997-4868-2020-200-9-48-54

16. Позовникова М.В., Ларкина Т.А., Вахрамеев А.Б., Федорова З.Л., Рябова А.Е., Рейнбах Н.Р. Идентификация SNPs в локусе LCORL-NCAPG и анализ их связи с экстерьером кур пушкинской породы. Птица и птицепродукты. 2023; (2): 30‒33. https://elibrary.ru/nbaopi

17. Рябова А.Е., Азовцева А.И., Дементьева Н.В. Влияние полиморфизма A503G в гене LCORL на живую массу петухов царскосельской породы. Аграрный вестник Северного Кавказа. 2023; (3): 25‒28. https://doi.org/10.31279/2949-4796-2023-3-51-25-28

18. Коршунова Л.Г., Карапетян Р.В. Использование генетических методов на основе ДНК-маркеров продуктивных признаков в селекции кур. Птицеводство. 2021; (5): 4‒7. https://doi.org/10.33845/0033-3239-2021-70-5-4-7

19. Мамонтова Т.В., Айбазов М.М. Генетические маркеры в селекции животных: опыт и перспективы (обзор). Сборник научных трудов Всероссийского научно-исследовательского института овцеводства и козоводства. 2016; 9(1): 480‒485. https://elibrary.ru/wvjhel

20. Коршунова Л.Г., Карапетян Р.В., Комарчев А.С., Куликов Е.И. Ассоциации однонуклеотидных замен в генах-кандидатах с хозяйственно полезными признаками у кур (Gallus gallus domesticus L.) (обзор). Сельскохозяйственная биология. 2023; 58(2): 205‒222. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2023.2.205rus