Определение уровня экспрессии гена LCORL в мышечной ткани северных оленей

В результате работы проведен всесторонний анализ связи транскрипционной активности гена LCORL в поперечной грудной мышце домашнего северного оленя ненецкой породы с его убойной массой.
Сравнительный анализ уровня относительной экспрессии гена LCORL в исследуемой ткани у оленей в различных группах по признаку «убойная масса» показал, что ген LCORL высоко экспрессируется в группе убойной массы 50,2–59,2 кг (Median = 0,367), а самое низкое значение экспрессии в группе оленей 60,2–75,0 кг (Median = 0,036). Анализ литературных источников выявил, что тканеспецифическая экспрессионная активность гена LCORL с учетом весовых характеристик оленей ранее не изучалась. Результаты настоящего исследования предоставляют новую информацию об особенностях экспрессии гена LCORL у домашних северных оленей ненецкой породы с учетом тканеспецифичности и убойной массы.
Анализ корреляционных связей с применением критерия Спирмена не выявил разнонаправленную зависимость уровня относительной экспрессии гена LCORL в образцах поперечной грудной мышцы с убойной массой оленей разных групп, что, видимо, может быть обусловлено особенностями выборки оленей.

1. Южаков А.К., Лайшев К.А. Особенности роста и формирования телосложения северных оленей ненецкой породы. Международный вестник ветеринарии. 2022; (2): 104–111. https://doi.org/10.52419/issn2072-2419.2022.2.104

2. Митюков А.С., Канева Л.А., Жариков Я.А. Вероятные направления производства мяса в северных регионах Российской Федерации. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2015; 39: 129–131. https://www.elibrary.ru/uxwmcf

3. Логинов В.Г. Оленеводство как базовая отрасль традиционного сектора АПК Севера. Аграрный вестник Урала. 2014; (11): 74–77. https://www.elibrary.ru/tajscb

4. Южаков А.А., Романенко Т.М., Лайшев К.А. Феногеографическая изменчивость северных оленей ненецкой породы. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2017; 47: 115–122. https://www.elibrary.ru/zbezqx

5. McDevitt A.D. et al. Survival in the Rockies of an endangered hybrid swarm from diverged caribou (Rangifer tarandus) lineages. Molecular Ecology. 2009; 18(4): 665–679. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2008.04050.x

6. Денискова Т.Е. и др. Генетическая характеристика региональных популяций ненецкой породы северного оленя (Rangifer tarandus). Сельскохозяйственная биология. 2018; 53(6): 1152–1161. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2018.6.1152rus

7. Харзинова В.Р., Зиновьева Н.А. Применение микросателлитов в популяционно-генетических исследованиях северного оленя (Rangifer tarandus) (обзор). Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2024; 25(4): 525–537. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2024.25.4.525-537

8. Metzger J., Schrimpf R., Philipp U., Distl O. Expression Levels of LCORL Are Associated with Body Size in Horses. PLoS ONE. 2013; 8(2): e56497. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0056497

9. Soranzo N. et al. Meta-Analysis of Genome-Wide Scans for Human Adult Stature Identifies Novel Loci and Associations with Measures of Skeletal Frame Size. PLoS Genetics. 2009; 5(4): e1000445. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000445

10. Lindholm-Perry A.K. et al. Association, effects and validation of polymorphisms within the NCAPG-LCORL locus located on BTA6 with feed intake, gain, meat and carcass traits in beef cattle. BMC Genetics. 2011; 12: 103. https://doi.org/10.1186/1471-2156-12-103

11. Rubin C.-J. et al. Strong signatures of selection in the domestic pig genome. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2012; 109(48): 19529–19536. https://doi.org/10.1073/pnas.1217149109

12. Al-Mamun H.A., Kwan P., Clark S.A., Ferdosi M.H., Tellam R., Gondro C. Genome-wide association study of body weight in Australian Merino sheep reveals an orthologous region on OAR6 to human and bovine genomic regions affecting height and weight. Genetics Selection Evolution. 2015; 47: 66. https://doi.org/10.1186/s12711-015-0142-4

13. Takasuga A. PLAG1 and NCAPG‐LCORL in livestock. Animal Science Journal. 2016; 87(2): 159–167. https://doi.org/10.1111/asj.12417

14. Lyu S., Arends D., Nassar M.K., Brockmann G.A. Fine mapping of a distal chromosome 4 QTL affecting growth and muscle mass in a chicken advanced intercross line. Animal Genetics. 2017; 48(3): 295–302. https://doi.org/10.1111/age.12532

15. Larkina T.A. et al. Evolutionary Subdivision of Domestic Chickens: Implications for Local Breeds as Assessed by Phenotype and Genotype in Comparison to Commercial and Fancy Breeds. Agriculture. 2021; 11(10): 914. https://doi.org/10.3390/agriculture11100914

16. Han Y.J., Chen Y., Liu Y., Liu X.L. Sequence variants of the LCORL gene and its association with growth and carcass traits in Qinchuan cattle in China. Journal of Genetics. 2017; 96(1): 9–17. https://doi.org/10.1007/s12041-016-0732-0

17. Betsha M.W. et al. Sequencing of reindeer (Rangifer tarandus) genomes: insights into evolution, domestication and adaptation. Bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB-2018). The 11th International conference. Novosibirsk: Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of Russian Academy of Sciences. 2018; 198. https://doi.org/10.18699/BGRSSB-2018-168

18. Weldenegodguad M. et al. Genome sequence and comparative analysis of reindeer (Rangifer tarandus) in northern Eurasia. Scientific Reports. 2020; 10: 8980. https://doi.org/10.1038/s41598-020-65487-y

19. Livak K.J., Schmittgen T.D. Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 2−ΔΔCT Method. Methods. 2001; 25(4): 402–408. https://doi.org/10.1006/meth.2001.1262

20. Крутикова А.А., Баркова О.Ю. Анализ полиморфизма гена лиганд-зависимого ядерого рецептора типа корепрессора северного оленя. Международный вестник ветеринарии. 2020; (4): 111–115. https://doi.org/10.17238/issn2072-2419.2020.4.111