Внутрипопуляционная генетическая дифференциация стада северных оленей Ямальской опытной станции

Актуальность. Повышение рентабельности северного оленеводства возможно путем внедрения современных методов ведения селекционно-племенной работы, в том числе основанного на популяционно-генетическом анализе.

Методы. Полиморфизм микросателлитов по 16 локусам у северных оленей ненецкой породы (n = 100) изучали с использованием набора COrDIS Reindeer. В программе Structure 2.3.4. генотипированных животных разделили на кластеры и по вероятности генетического соответствия объединили в группы. По каждой группе провели оценку основных генетических параметров, рассчитали степень генетического сходства между кластерами (k) и популяцией (Pop) в целом.

Результаты. Максимальное количество наблюдаемых и эффективных STR-аллелей установили в k5 (6,188 и 3,903 соответственно). По величине индекса Шеннона минимальным генетическим разнообразием (I = 1,202) характеризовался первый кластер, пятый — напротив, максимальным (I = 1,414). По k1, k4 и k5 установлен незначительный избыток гетерозигот (-0,061–0,029), а в целом по популяции отмечалась их небольшая редукция (Fis = 0,017). У особей k1 выявлены приват-аллели Rt6186 и C276259 с суммарной частотой 0,060, характерные для k2 микросателлиты Rt7240 и FCB193138 встречались с общей частотой 0,079, в k4 суммарная частота встречаемости приват-аллелей Rt1267, BMS745330, NVHRT16142 составила 0,100, в k5 приват-аллели BMS1788150, Rt30223, Rt7254, OheQ299, Rt24248 обнаружили у 21,9% животных. Генетическая дистанция (DN) была минимальной между k2 и k4 (0,043), максимальной — между k2 и k3 (0,119). По отношению к популяции в целом максимальная генетическая дистанция прослеживалась у k3 (DN = 0,049), а наименьшая — у k2 (DN = 0,025). Самая высокая оценка по Dest-статистике получена при сравнении пар Pop-k1 и Pop-k3 (Dest = 0,021) и отсутствовала между Pop-k2 и Pop-k5 (Dest = -0,004–0,002).

1. Южаков А.А., Романенко Т.М., Лайшев К.А. Новые знания, методы и модели в разведении, экологии и эпизоотологии северных оленей. СПб.: Северо-Западный центр междисциплинарных исследований проблем продовольственного обеспечения. 2018; 72. ISBN 978-5-9905152-9-1 https://elibrary.ru/uxxmiy

2. Романенко Т.М., Митюков А.С. Экстерьерные особенности северных оленей острова Колгуев и Малоземельской тундры в сравнительном аспекте. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2011; 24: 113‒118. https://elibrary.ru/pgfvrf

3. Романенко Т.М., Вылко Ю.П. Краниологическая характеристика северных оленей (Rangifer tarandus) ненецкой породы Тиманской и Большеземельской тундры Ненецкого АО. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2019; (12): 110‒114. https://doi.org/10.17513/mjpfi.12964

4. Зуев С.М., Деттер Г.Ф. Селекционно-племенная работа в северном оленеводстве Ямало-Ненецкого автономного округа. Научный вестник Ямало-Ненецкого автономного округа. 2021; (2): 27‒45. https://doi.org/10.26110/ARCTIC.2021.111.2.002

5. Глазко В.И. Проблемы «селекции с помощью маркеров» (MAS). Farm animals. 2013; (2): 16‒22. https://elibrary.ru/qjczmf

6. van de Goor L.H.P., Panneman H., van Haeringen W.A. A proposal for standardization in forensic bovine DNA typing: allele nomenclature of 16 cattle-specific short tandem repeat loci. Animal Genetics. 2009; 40(5): 630‒636. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2009.01891.x

7. Radko A., Rychlik T. Use of blood group tests and microsatellite DNA markers for parentage verification in a population of Polish Red-and-White cattle. Annals of Animal Science. 2009; 9(2): 119‒125.

8. Харзинова В.Р. и др. Разработка мультиплексной панели микросателлитов для оценки достоверности происхождения и степени дифференциации популяций северного оленя Rangifer tarandus. Сельскохозяйственная биология. 2015; 50(6): 756‒765. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2015.6.756rus

9. Кол Н.В., Королев А.Л., Захаров И.А. Полиморфизм митохондриальной ДНК в тувинской популяции северного оленя (Rangifer tarandus L.). Генетика. 2006; 42(1): 110‒112. https://elibrary.ru/htefyf

10. Королев А.Н. и др. Полиморфизм контрольного региона мтДНК северных оленей (Ranifer tarandus) материковой части европейского северо-востока. Зоологический журнал. 2017; 96(1): 106‒118. https://doi.org/10.7868/S0044513417010147

11. Харзинова В.Р., Денискова Т.Е., Сермягин А.А., Доцев А.В., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А. Эволюция методов оценки биоразнообразия северного оленя (Rangifer tarandus) (обзор). Сельскохозяйственная биология. 2017; 52(6): 1083‒1093. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2017.6.1083rus

12. Матюков В.С. К геногеографии и экологической генетике северного оленя (Rangifer tarandus). Актуальные вопросы развития сельского хозяйства. Материалы круглого стола с международным участием «Актуальные вопросы развития сельского хозяйства», научного совещания «Современное состояние, проблемы и перспективы развития овцеводства на Крайнем Севере России», Межрегиональной научно-практической конференции «Печорская сельскохозяйственная опытная станция: историческое развитие, современное состояние», V Межрегионального интеллектуального форума «Инновационный потенциал — будущее регионов России», посвященных 115-летию Печорской естественно-исторической станции Императорской академии наук, 110-летию Печорской сельскохозяйственной опытной станции, 100-летию Республики Коми. Сыктывкар: Коми республиканская академия государственной службы и управления. 2021; 90‒100. https://doi.org/10.19110/93206-022-17

13. Николаев С.В., Матюков В.С., Филатов А.В. Изменения микросателлитного профиля в опытном стаде северных оленей ненецкой породы. Международный вестник ветеринарии. 2023; (3): 275‒283. https://doi.org/10.52419/issn2072-2419.2023.3.275