Мониторинг распространения вируса гриппа птиц на территории Казахстана

Грипп птиц, вызываемый вирусами гриппа типа А, представляет серьезную угрозу для промышленного птицеводства и здоровья человека ввиду способности некоторых подтипов вируса преодолевать межвидовой барьер. По данным исследований, в 2020 г. в Республике Казахстан были зарегистрированы 98 случаев вспышек гриппа А/H5N8 среди птиц. В результате анализа выделенные вирусы А/H5N8 по сайту расщепления с последовательностью PLREKRRKR/G были отнесены к высокопатогенному вирусу гриппа птиц (ВПГП). Филогенетический анализ выделенных изолятов по гемагглютинину позволил отнести их к клайду 2.3.4.4b евразийской линии II (Eurasian HPAIV H5N8 Lineage II). Уровень гомологии казахстанских штаммов вируса гриппа А со штаммами, выделенными в Китае в 2020–2021 гг., составил 98,42–98,70%.

1. Swayne D.E., Suarez D.L. Highly pathogenic avian influenza. Rev Sci Tech. 2000; 19(2): 463–482. 2. https://doi.org/10.20506/rst.19.2.1230

2. Webster R.G., Govorkova E.A. Continuing challenges in influenza. Annals of the New York Academy of Sciences. 2014; 1323: 115–139. https://doi.org/10.1111/nyas.12462

3. Sayatov M.Kh., Bogdanova V.S., Mamadaliyev S.M. Ecology of influenza viruses in Kazakhstan. International Journal of Biology and Chemistry. 2020; 13(1); 39–45. https://doi.org/10.26577/ijbch.2020.v13.i1.05

4. Payungporn S. et al. Single-Step Multiplex Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for Influenza A Virus Subtype H5N1 Detection. Viral Immunology. 2004; 17(4): 588–593.

5. S., Stecher G., Li M., Knyaz C., and Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution. 2018; 35: 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096

6. 6. Lewis N.S. et al. Emerging avian influenza viruses: Current knowledge on zoonotic risk and biosafety recommendations. Epidemiology and Infection. 2022; 150: (e71): 1–13. https://doi.org/10.1017/S0950268822000474

7. Yamaji R. et al. Pandemic potential of highly pathogenic avian influenza clade 2.3.4.4 A(H5) viruses. Reviews in Medical Virology. 2020; 30(3): e2099. https://doi.org/10.1002/rmv.2099

8. Adlhoch C. et al. Avian influenza overview December 2020 — February 2021. EFSA Journal 2021; 19(3): 6497: 73. https://doi.org/10.2903/j.efsa.2021.6497

9. Bi Y. et al. Genesis, Evolution and Prevalence of H5N6 Avian Influenza Viruses in China. Cell Host & Microbe. 2016; 20(6): 810–821. https://doi.org/10.1016/j.chom.2016.10.022