Сравнительная генетическая оценка двух популяций северного оленя ненецкой породы уральского экотипа

Актуальность. Исследования в области популяционной генетики являются одним из основных инструментов для формирования стратегии селекционно-племенной работы и повышения экономической эффективности северного оленеводства.

Методы. Объектом исследования являлись северные олени Республики Коми (PSK, n = 100) и Ямало-Ненецкого автономного округа (ЯНАО) (YOS, n = 100). Для генетического анализа использовали выщипы из ушной раковины и пантов. Генотип животных определяли по 16 микросателлитным маркерам с помощью тест-системы COrDIS Reindeer методом мультиплексной ПЦР. Статистический анализ выполнен в программе GenAlEx 6.503.

Результаты. Индекс Шеннона указывал на высокое аллельное разнообразие в локусах Rt1 (PSK) и OheQ (PSK, YOS), минимальное — в BMS745 и C276. Популяция PSK отличалась высокой наблюдаемой гетерозиготностью в Rt9 (0,940) и низкой — в C143 (0,430), а среди животных ЯНАО максимальные значения были в Rt1 и OheQ (0,880), минимальные — в C143 и C276 (0,350). Оценка индекса фиксации у оленей PSK выявила избыток гетерозиготности в Rt9 и Rt6, дефицит — в BMS1788, а у животных YOS избыток был в T40, дефицит — в C276. Популяция PSK имела более высокий запас гетерозиготности (0,040, р ≤ 0,05) по отношению к YOS. Комплексный анализ выявил 7 уникальных последовательностей у оленей PSK и 4 — у YOS. Частоты приватных аллелей составили 6% и 4% соответственно. Индекс фиксации Райта показал умеренную дивергенцию между популяциями в локусах BMS1788, Rt1, C143, C276 и C32, значительную дивергенцию — в BMS745. Оценки по Gst и Dest подтвердили полученные результаты. В целом популяция YOS оказалась менее генетически разнообразна по сравнению с PSK. Для снижения уровня инбридинга в стаде YOS необходимо организовать завоз производителей из других популяций. 

1. Мухачев А.Д., Харючи Г.П., Южаков А.А. Кочующие через века: оленеводческая культура и этноэкология тундровых ненцев. Салехард; Екатеринбург: Креативная команда «Кипяток». 2010;135.ISBN 978-5-904781-05-7https://www.elibrary.ru/qlbivr

2. Южаков А.А., Романенко Т.М., Лайшев К.А. Новые знания, методы и модели в разведении, экологии и эпизоотологии северных оленей. СПб.; Пушкин: СЗЦППО. 2018; 72.ISBN 978-5-9905152-9-1https://www.elibrary.ru/uxxmiy

3. Ильина Л.А. и др. Популяционная структура микробных сообществ в рубце северных оленей Российской Арктики в зимний период по данным высокопроизводительного секвенирования. Генетика и разведение животных. 2019; (2): 90–96.https://doi.org/10.31043/2410-2733-2019-2-90-96

4. Laishev K.A., Ilyina L.A., Filippova V.A., Dunyashev T.P., Laptev G.Yu.,Abakumov E.V. Rumen bacterial community of young and adultof reindeer (Rangifer tarandus) from Yamalo-Nenets AutonomousDistrict of Russia. Open Agriculture. 2020; 5(1): 10–20.https://doi.org/10.1515/opag-2020-0001

5. Южаков А.А., Мухачев А.Д., Лайшев К.А. Породы и проблемы селекции северных оленей России. М.: Наука. 2023; 151.ISBN 978-5-02-040992-7https://www.elibrary.ru/uxnwum

6. Харзинова В.Р., Денискова Т.Е., Сермягин А.А., Доцев А.В., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А. Эволюция методов оценки биоразнообразия северного оленя (Rangifer tarandus) (обзор).Сельскохозяйственная биология. 2017; 52(6): 1083–1093.https://doi.org/10.15389/agrobiology.2017.6.1083rus

7. Николаев С.В., Матюков В.С., Филатов А.В. Внутрипопуляционная генетическая дифференциация стада северных оленей Ямальской опытной станции. Аграрная наука. 2024; (11): 82–86.https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-388-11-82-86

8. Романенко Т.М., Митюков А.С. Экстерьерные особенности северных оленей острова Колгуев и Малоземельской тундрыв сравнительном аспекте. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2011; 24: 113–118.https://www.elibrary.ru/pgfvrf

9. Глазко В.И. Проблемы «Селекции с помощью маркеров» (MAS).Farm animals. 2013; (2): 16–22.https://www.elibrary.ru/qjczmf

10. Смарагдов М.Г. Тотальная геномная селекция с помощью SNPкак возможный ускоритель традиционной селекции. Генетика.2009; 45(6): 725–728.https://www.elibrary.ru/kmlmwr

11. Федоров В.И., Румянцева Т.Д., Роббек Н.С., Слепцов Е.С., Винокуров Н.В. К вопросу адаптации северных домашних оленей эвенской породы к горно-таежной зоне северо-востока России. Генетика и разведение животных. 2018; (1): 115–121.https://doi.org/10.31043/2410-2733-2018-1-115-121

12. Колосова О.Н., Кершенгольц Б.М. Сезонные изменения уровня эндогенных этанола и ацетальдегида в крови крупных растительноядных млекопитающих Арктики и Субарктики. Природные ресурсы Арктики и Субарктики. 2022; 27(2): 268–276 (на англ. яз.).https://doi.org/10.31242/2618-9712-2022-27-2-268-276

13. Николаев С.В., Матюков В.С., Филатов А.В. Изменениями кросателлитного профиля в опытном стаде северных оленей ненецкой породы. Международный вестник ветеринарии. 2023;(3): 275–283.https://doi.org/10.52419/issn2072-2419.2023.3.275